1、結(jié)果不同。權(quán)利人超過保證期間訴請權(quán)利的，法律對于權(quán)利人的實體權(quán)利不予保護(hù)，即，義務(wù)人因權(quán)利人怠于行使權(quán)力而免責(zé)，債權(quán)債務(wù)關(guān)系終止。而權(quán)利人如果在訴訟時效期間怠于行使權(quán)力的，權(quán)利人的實體權(quán)利并不喪失，其喪失的為勝訴權(quán)，即權(quán)利人的訴訟利益將無法獲得法律保護(hù)，根據(jù)《民法通則》第138條規(guī)定：“超過訴訟時效期間，當(dāng)事人自愿履行債務(wù)的，不受訴訟時效限制”，從此法律規(guī)定可以也可以看出，權(quán)利人超過訴訟時效訴請權(quán)利的，其實體權(quán)利依然存在。

2、保證期間具有約定性和法定性，訴訟時效是法定的，不可以約定。根據(jù)我國法律規(guī)定，保證期間原則上是約定期間，可以由當(dāng)事人自有協(xié)商確定，在當(dāng)事人沒有約定或者約定不明或約定無效時，適用法定的保證期間。而訴訟時效為法律的強(qiáng)制性規(guī)定，根據(jù)《最高人民法院關(guān)于審理民事案件適用訴訟時效制度若干問題的規(guī)定》第2條、第3條規(guī)定，當(dāng)事人違反法律規(guī)定，約定延長或者縮短訴訟時效期間、預(yù)先放棄訴訟時效利益的，人民法院不予支持的規(guī)定，當(dāng)事人不能預(yù)先排除或妨礙訴訟時效的適用，否則其約定無效。

3、保證期限是不變期間，訴訟時效是可變期間。保證期間為除斥期間，根據(jù)除斥期間理論，除斥期間為不變期間，權(quán)利人超過除斥期間怠于行使權(quán)力將使權(quán)利義務(wù)歸于消滅(《擔(dān)保法》第31條)，設(shè)立除斥期間的目的是為了督促權(quán)利人及時行使權(quán)利，使權(quán)利義務(wù)的不特定性歸于確定，同時保障法律關(guān)系的穩(wěn)定。訴訟時效與保證期間有別，訴訟時效可以因特定事由中止、中斷、延長。由于保證期間上述特性，要求權(quán)利人必須在一定期限內(nèi)行使權(quán)利，這無疑加大了權(quán)利人的責(zé)任，在實務(wù)中，往往有權(quán)利人因?qū)Ψ刹涣私舛鴨适ПＷC權(quán)利的案件發(fā)生，因此，為了維護(hù)權(quán)利人的合法權(quán)益，不因由于超過保證期間行使權(quán)利而蒙受重大損失，權(quán)利人必須與保證人就保證期間達(dá)成約定，且約定必須明確。根據(jù)《擔(dān)保法解釋》第32條，保證合同約定的保證期間早于或者等于主債務(wù)履行期限的，視為沒有約定，保證期間為主債務(wù)履行期滿之日起6個月。保證合同約定保證人承擔(dān)保證責(zé)任直至主債務(wù)本息還清為止等類似內(nèi)容的，視為約定不明，保證期間為主債務(wù)履行期限屆滿之日起2年。

二、擔(dān)保物權(quán)的期限是多久

實現(xiàn)擔(dān)保物權(quán)最長時間即訴訟時效為3年。擔(dān)保物權(quán)人在債務(wù)人不履行到期債務(wù)或者發(fā)生當(dāng)事人約定的實現(xiàn)擔(dān)保物權(quán)的情形，依法享有就擔(dān)保財產(chǎn)優(yōu)先受償?shù)臋?quán)利，但是法律另有規(guī)定的除外。債權(quán)人在借貸、買賣等民事活動中，為保障實現(xiàn)其債權(quán)，需要擔(dān)保的，可以依照本法和其他法律的規(guī)定設(shè)立擔(dān)保物權(quán)。第三人為債務(wù)人向債權(quán)人提供擔(dān)保的，可以要求債務(wù)人提供反擔(dān)保。反擔(dān)保適用本法和其他法律的規(guī)定。設(shè)立擔(dān)保物權(quán)，應(yīng)當(dāng)依照本法和其他法律的規(guī)定訂立擔(dān)保合同。擔(dān)保合同包括抵押合同、質(zhì)押合同和其他具有擔(dān)保功能的合同。擔(dān)保合同是主債權(quán)債務(wù)合同的從合同。主債權(quán)債務(wù)合同無效的，擔(dān)保合同無效，但是法律另有規(guī)定的除外。